Ακολουθεί μια απλή αναλογία: Πριν από δεκαετίες, οι τηλεοπτικοί σταθμοί συνήθιζαν να μεταδίδουν ένα κυκλικό μοτίβο δοκιμών αφού ο κανονικός προγραμματισμός είχε τελειώσει για την ημέρα. Ας πούμε ότι τα γονίδια μας είναι σαν αυτό το μοτίβο δοκιμής που μεταδίδεται. Το μοντέλο της επιγενετικής επιτρέπει, στη συνέχεια, τον έλεγχο μέσω όλων των κλήσεων και των κουμπιών της τηλεόρασης. Μπορώ να ενεργοποιήσω και να απενεργοποιήσω την τηλεόραση. Μπορώ να αυξήσω την ένταση. Μπορώ να αλλάξω το χρώμα, την απόχρωση, την αντίθεση, την οριζόντια, την κατακόρυφη - Μπορώ να αλλάξω κάθε ένα από αυτά, αλλά, με αυτόν τον τρόπο, δεν άλλαξα την αρχική εκπομπή. Όχι, άλλαξα μόνο την ανάγνωση της μετάδοσης και αυτές οι παραλλαγές είναι δυνητικά απεριόριστες.
Η διάκριση μεταξύ αυτού που ελέγχεται από τα γονίδια μας και αυτού που ελέγχεται από επιγενετική επιλογή ορίζεται νωρίς στην ανθρώπινη ανάπτυξη. Η ανθρώπινη ανάπτυξη χωρίζεται σε δύο φάσεις - η πρώτη είναι η φάση του εμβρύου, ακολουθούμενη από τη φάση του εμβρύου. Η εμβρυϊκή φάση αναγνωρίζεται Όταν το έμβρυο αποκτά ανθρώπινα χαρακτηριστικά και μοιάζει με άνθρωπο τότε ονομάζεται έμβρυο. Το εμβρυολογικό στάδιο εκτείνεται από το μοναδικό γονιμοποιημένο ωάριο μέσω όλων των πρώτων μικρών μορφών και του σχήματος αλλάζει μέχρι να φτάσει στο στάδιο του εμβρύου.
Τα γονίδιά μας είναι οι θεμελιώδεις προγραμματιστές που μεταφέρουν το γονιμοποιημένο αυγό στο στάδιο που μοιάζει με άνθρωπο. Έως τότε, το γονιδιακό πρόγραμμα έχει εκπονήσει το σχέδιο του ανθρώπινου σώματος με δύο χέρια, δύο πόδια και μύτη, μάτια, κ.λπ. Από το στάδιο του εμβρύου, οι τροποποιήσεις ελέγχονται τώρα επιγενετικά, που σημαίνει ότι το περιβάλλον τους επηρεάζει.
Για παράδειγμα, μόλις γίνει η ανθρώπινη μορφή, οι επιγενετικές αλλαγές μπορούν να ελέγξουν εάν η ανάπτυξη οδηγεί σε μεγάλους δυνατούς μύες και χέρια για μάχη σε έναν μεγαλύτερο εγκέφαλο για σκέψη. Αυτές οι αποφάσεις βασίζονται σε περιβαλλοντικές πληροφορίες τη στιγμή που το έμβρυο αναπτύσσεται. Το σπέρμα και τα αυγά είναι γενικά. Σχηματίζουν έναν άνθρωπο, αλλά δεν καθορίζουν εάν αυτός ο άνθρωπος θα γεννηθεί στη Βοσνία ή Ζιμπάμπουε ή στην Αϊόβα. Κάθε ένα από αυτά τα περιβάλλοντα απαιτεί διαφορετική φυσιολογία για να επιβιώσει. Για παράδειγμα, εάν απειλείται η επιβίωση τότε η φυσιολογία του σώματος αλλάζει για να δημιουργήσει ένα σώμα που θα αντέξει σε αυτήν την απειλή. Οι πληροφορίες από το περιβάλλον είναι πολύ κρίσιμες για τη διαμόρφωση της έκφρασης των γονιδίων που έχουν ήδη χρησιμοποιηθεί στην κατασκευή του σχεδίου ανθρώπινου σώματος.